مقدمه: سودوموناس های فلورسنت سیدروفورهای متعددی را تولید می کنند که مهم ترین آنها سیدروفور نوع پایووردین است. تولید سیدروفور در این باکتری ها باعث افزایش فراهمی آهن موردنیاز باکتری و گیاهان می شود و همچنین اهمیت ویژه ای در کنترل بیماری های گیاهی دارد.مواد و روش ها: به منظور مقایس ه روش های اندازه گیری تولید سیدروفور، میزان تولید سیدروفور 21 سویه سودوموناس بومی ایران به همراه دو سویه مرجع خارجی و یک سویه باسیلوس با روش کیفی CAS-Agar، روش نیمه کمی CAS-AD و روش کمی اسپکتروفتومتری با استفاده از سیدروفور خالص اندازه گیری شد.نتایج: در روش CAS-Agar به علت وجود ماده شوینده HDTMA رشد سلولی تعدادی از سویه ها محدود و درنتیجه تولید سیدروفور آنها پایین بود. در روش CAS-AD همه باکتری ها قادر به تولید سیدروفور بودند که بیشترین و کمترین مقدار تولید مربوط به P. fluorescens UTPF76 و P. fluorescens UTPF45 با تولید معادل 1.005 و 0.0026 میلی گرم در لیتر دفروکسامین بود. در دو روش اخیر سویه باسیلوس و موتانت پایووردین P. aeruginosa MPFM1 به میزان کمی تولید سیدروفور کردند که نشان دهنده غیرانتخابی بودن این روش ها به نوع سیدروفور بود. در روش کمی فقط سیدروفور نوع پایووردین قابل اندازه گیری بود که سویه های P. aeruginosa MPFM1 و Bacillus sp. قادر به تولید آن نبودند.بیشترین میزان تولید پایووردین مربوط به سویه خارجی 7NSK2 با 625.29 میکرومول بر لیتر بود و در پی آن سویه های P. fluorescens UTPF65، P. fluorescens UTPF81 و P. fluorescens UTPF87 در رتبه بعدی قرار گرفتند.بحث و نتیجه گیری: در مجموع روش CAS-AD بهترین روش برای بررسی میزان تولید سیدرفور کل و روش اسپکتروفتومتری نیز روشی دقیق و کارا برای تشخیص سیدروفور نوع پایووردین است که عمدتا توسط سودوموناس های فلورسنت تولید می شود.

آکادمی علوم چین(CAS)، در نوامبر سال 1949 طبق دستور تشکیلات قانونگذار حکومت مرکزی جمهوری خلق چین تحت سرپرستی شورای ایالتی به منظور اداره و انجام تحقیقات علمی تاسیس گردند. این آکادمی بالاترین موسسه آکادمیک و همچنین مرکز پژوهشی جامع علوم در چین است. رسالت و ماموریت آکادمی شامل تعیین خط مشی ها و هدفمند کردن تحقیقات علمی، آموزش و تربیت نیروی متخصص و کارآمد و بازسازی و قدرتمند نمودن مراکزعلمی تحقیقانی است . در راستای اهداف فوق ، تشویق و دعوت به  کار دانشمندان چینی مقیم خارج کشور نیز منجر به برگشت بی سابقه دانشمندان چینی در سال 1950 و افرایش توان علمی و عملکردی آکادمی گردید. آکادمی دارای پنج بخش آکادمیک 108 مرکز تحقیقاتی علمی، بیش از 200 سرمایه گذار علمی و فن آوری و بالای 20 واحد حمایت کننده است که شامل یک دانشگاه و پنج مرکز داده و اطلاعات می باشد. این مراکز درنقاط مختلفی از کشور گسترده شده اند و هدف آنها علاوه برتحقیق وپژوهش، بومی نمودن علم و تطبیق آن با نیازهای روز جامعه می باشد. آکادمی دارای بیش از 58000 کارمند و حدود 39000 هیات علمی می باشند. آکادمی نقش بسیار موثری در انجام تحقیقات منجر به تولید فن آوری برتر در کشور داشته و دارد.

در این آزمایش 14 سویه ازتوباکتر کروکوکوم جداسازی شده از مزارع گندم اطراف تبریز از نظر توان تولید سیدروفور در شرایط درون شیشه ای با استفاده از محیط کشت جامد حاوی کروم آزرول-اس مورد ارزیابی قرار گرفتند که برخی از سویه های مورد بررسی از توان تولید سیدروفور نسبتا بالائی برخوردار بودند. سپس با استفاده از خاک سترون در یک آزمایش گلخانه ای با گیاه گندم بهاره رقم فلات در قالب طرح کاملا تصادفی با 16 تیمار شامل 14 سویه باکتری، شاهد مثبت (با کود نیتروژن و بدون باکتری) و شاهد منفی (بدون کود نیتروژن و بدون باکتری) با چهار تکرار، اثر آنها بر جذبFe ، Zn، Mn و Cu توسط این گیاه مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج تجزیه آماری و مقایسه میانگین ها نشان داد که مایه زنی با باکتری بر غلظت و مقدار عناصر Fe، Zn و Cu بخش هوائی و ریشه گیاه، مقدار Mn ریشه گیاه و همچنین انتقال عناصر Fe، Zn و Cu از ریشه به بخش هوائی اثر معنی داری داشت. اثر مایه زنی باکتری بر غلظت و مقدار Mn بخش هوائی، غلظت Mn ریشه و انتقال Mn از ریشه به بخش هوائی معنی دار نشد. نتایج نشان داد سویه های برتری که در شرایط درون شیشه ای از توان تولید سیدروفور بالائی برخوردار بودند باعث افزایش غلظت و مقدار Fe و همچنین انتقال این عنصر از ریشه به بخش هوائی گیاه گندم شده اند.

1عفونت بوسیله باکتریوفاژها یکی از چالش­های مهم کاربرد باکتری­های مختلف در صنایع می­باشد. یکی از سیستم­های ضد ویروسی ذاتی در باکتری­ها سیستم CRISPR/Cas می باشد و تعیین ویژگی این سیستم­ها در باکتری­ها می­تواند در فرمولاسیون و بکارگیری این باکتری­ها نقش کمک کننده­ای داشته باشد. بر این اساس و به منظور شناسایی سیستم CRISPR/Cas در باکتری­های جنس لوکونوستوک، توالی ژنوم کامل 18 گونه شناسایی شده­ی این جنس مورد کاوش قرار گرفت و اطلاعات سیستم CRISPR/Cas آن­ها بر اساس الگوریتم­های مبتنی بر همولوژی بررسی گردید. در مرحله بعد ویژگی­های مربوط به ساختارهای کونفورماسیونی و پایداری سیستم­های شناسایی شده بر اساس انرژی آزاد تعیین، جایگاه شناسایی فاژها (PAM) با استفاده از رویکردهای مبتنی بر BLAST شناسایی، و در نهایت روابط خویشاوندی این سیستم­ها بر اساس توالی آمینواسیدی پروتئین­های همراه مورد ارزیابی قرار گرفت. بر اساس نتایج بدست آمده از مجموع 18 گونه ثبت شده برای این جنس در NCBI، 9 گونه­ دارای سیستم CRISPR/Cas کامل بودند. نتایج مربوط به تعیین نوع سیستم CRISPR/Cas ، نشان داد که غیر از یک مورد، همه سویه­ها حاوی سیستم نوع II-A  می­باشند. تعداد توالی­های تکراری در این سیستم­ها بین 4 تا 101 عدد و طول متوسط توالی­های فاصله دهنده  بین 28 تا 30 نوکلوئوتید متغییر بودند. در مجموع 9 نوع توالی PAM در انتهای ´3 و 9 نوع توالی  PAM در انتهای ´5  این سیستم­ها شناسایی شد. بر اساس نتایج آنالیز خویشاوندی، این سیستم­ها در دو گروه اصلی تقسیم­بندی شدند. به نظر می­رسد سیستم CRISPR/Cas نوع II-A فعال­ترین سیستم بر علیه DNA مهاجم خارجی و عفونت­های باکتریوفاژی در باکتری­های جنس لوکونوستوک باشد.

خواص ساختاری الکترونی بلور کلسیم سولفید با استفاده از روش FP-LAPW محاسبه شده است. برای انجام محاسبات از تقریبهای چگالی موضعی (LDA) و شیب تعمیم یافته (GGA) برای جمله تبادلی همبستگی استفاده شده است. خواص ساختاری حالت زمینه برای فازهای اول (ساختار نمک طعام) و دوم (ساختار کلرید سزیم) بررسی شد. مقادیر بدست آمده از جمله پارامتر تعادلی شبکه، مدول تراکمی، مشتق مدول تراکمی نسبت به فشار و فشار گذار، سازگاری خوبی با نتایج تجربی دارند. خواص الکترونی برای هر دو فاز مورد بررسی قرار گرفت. مقدار گاف انرژی محاسبه شده مانند محاسبات دیگران که بر نظریه تابعی چگالی استوار است کوچکتر از مقدار تجربی بدست آمد. این اختلاف ناشی از نادیده گرفتن ناپیوستگی در پتانسیل تبادلی همبستگی در محاسبات مبتنی بر نظریه تابعی چگالی است. انگل و وسکو پتانسیل تبادلی دقیق را برای چند اتم، با استفاده از مدل پتانسیل بهینه شده، بدست آوردند و سپس با استفاده از رابطه ویریال پتانسیل تبادلی همبستگی جدید EV-GGA را ارایه کردند. با به کار بردن پتانسیل تبادلی همبستگی جدید گاف انرژی بدست آمده به تجربه نزدیک تر شد. در نهایت در مورد امکان وجود فاز سوم (ساختار بلند روی) در این بلور تحقیق کردیم.

پیشرفت صنعت آبزی پروری با چالش های متعددی از جمله شیوع بیماری های عفونی و عوامل بیماری زای مقاوم به آنتی بیوتیک ها، کاهش بقاء، کاهش باروری، رشد آهسته، فرار ماهیان پرورشی به اکوسیستم های طبیعی و آلودگی های زیست محیطی مواجه است. امروزه استفاده از فناوری CRISPR-Cas به عنوان یک راه حل بالقوه برای حل این چالش ها از طریق ویرایش ژنوم یاد می شود. در فناوری CRISPR، آنزیم نوکلئاز 9 (Cas9) ابزاری قدرتمند و کارآمد برای ویرایش مولکولی DNA جهت بروز صفات مطلوب در میزبان است. در این زمینه مطالعات متعددی بر گونه های مختلف آبزیان با هدف بررسی صفات مطلوب مرتبط با آبزی پروری شامل سرکوب ژن Myostatin (افزایش رشد سوماتیک بدن)، بیوسنتز اسیدهای چرب، تحریک رنگدانه سازی بدن و تولید ماهیان با استخوان های ریز بین عضلانی کمتر صورت گرفته است. در خصوص صفات وابسته به تولید مثل، از این تکنولوژی جهت مهندسی ژنتیک سلول های جنسی و تغییر جنسیت استفاده شده است. در زمینه بهداشت آبزیان این سیستم اصلاحی برپایه ژنوم، در مقیاس آزمایشگاهی با موفقیت توانسته است، ماهیانی مقاوم در برابر بیماری های عفونی به خصوص بیماری های ویروسی تولید کند. همچنین ویرایش ژن های مرتبط با پپتیدهای ضدمیکروبی به وسیله CRISPR-Cas9 می تواند سبب بهبود سیستم ایمنی ذاتی و افزایش مقاومت ماهیان در برابر بیماری های عفونی می شود. به طورکلی، استفاده از فناوری CRISPR-Cas یک رویکرد موثر برای دستکاری ژن های هدف و بهبود ویژگی های اقتصادی در گونه های مختلف آبزیان در راستای برنامه های اصلاح ژنتیکی است. این مطالعه مروری، تصویر جامعی از فناوری CRISPR-Cas و پتانسیل آن در ویرایش ژنوم برای هدف قرار دادن ژن های مرتبط با صفات اقتصادی در ماهیان جهت غلبه بر برخی محدودیت ها و چالش های پیشروی آبزی پروری پایدار ارائه می دهد.

هدف: هدف از انجام این مطالعه ارزیابی و مقایسه دو محیط Candida ID agar و agar Candida CHROM برای تعیین گونه های کاندیدا جداشده از نمونه های بالینی می باشد.روش بررسی: تعداد 150 نمونه بیماران مبتلا به کاندیدیازیس بر روی دو محیط مورد مطالعه کشت داده و همچنین مخمرهای جداشده با استفاده از کیت Api به عنوان روش استاندارد تعیین گونه شدند تا کارآیی این دو محیط با هم مقایسه شود. از آزمون ارزیابی تستهای آزمایشگاهی (حساسیت و وی‍ژگی) برای مقایسه نتایج استفاده شد.یافته ها: با استفاده از محیط کشت های جدید مانند Candida ID agar و CHROM agar Candida امکان تشخیص سریع غالب گونه های کاندیدا و خصوصا کاندیدا آلبیکنس در ظرف 24 ساعت پس از کشت نمونه فراهم شد.نتیجه گیری: در مطالعه حاضر، محیط Candida ID agar حساسیت 96.4% داشت که خیلی بیشتر از محیط کشت CHROM agar Candida با حساسیت 51% در تشخیص افتراقی مخمرها خصوصا گونه کاندیدا آلبیکنس بود.

بیماری های گیاهی ناشی از ویروس ها تهدیدی جدی برای تولید محصولات کشاورزی در جهان است و مهندسی ضدویروس که توسط بیوتکنولوژی مولکولی آغاز شده است، استراتژی موثری برای پیشگیری و کنترل ویروس های آلوده کننده ی گیاهی محسوب می شود. پیشرفت های اخیر در ویرایش هدفمند دی. ان. ا یا آر. ان. ا با سیستم تکرار کوتاه پالیندرومیک یا مرتبط با CRISPR از ابزارهای قابل استفاده در زمینه محافظت از گیاهان در برابر ویروس ها است. در این مقاله مروری، توسعه سیستم های CRISPE/Cas مورد بررسی قرار می گیرد و برنامه های آن ها در کنترل ویروس های مختلف گیاهی با هدف قرار دادن توالی های ویروسی یا ژن های حساسیت در میزبان ذکر می شود. علاوه بر این، برخی از ژن های مقاومت بالقوه مغلوب را که قابل استفاده در اصلاح گیاهان علیه ویروس ها هستند، معرفی و بر اهمیت اصلاح ضدویروسی مبتنی بر ژن مغلوب برای تولید گیاهان عاری از ویروس بدون نقص رشد، تاکید می شود. همچنین چالش ها و فرصت های استفاده از تکنیک های CRISPR/Cas در پیشگیری و کنترل ویروس های گیاهی مورد بحث قرار می گیرد.

این بررسی با هدف مقایسه پتانسیل تولید سیدروفور ریزوبیوم های بومی و انتخاب سویه های برتر، به منظور استفاده از آنها به عنوان ریزوباکتریهای محرک رشد گیاه (PGPR) در کشت گیاهان زراعی لگوم و غیرلگوم، انجام شده است. به این منظور، 447 جدایه از گروههای مختلف ریزوبیومی که از لگومهای مهم زراعی، کشت شده در خاکهای مناطق مختلف ایران، جداسازی و براساس روش های استاندارد. شناسایی شده بودند. مورد آزمایش قرار گرفتند. بعلاوه از 29 سویه پسودوموناس فلورسنس به عنوان شاهد مثبت (Side+) استفاده شد. توان تولید سیدروفور این سویه ها، با استفاده از محیط جامد حاوی کرم آزورل s ( CAS_آگار) مورد سنجش قرار گرفت. به دلیل حضور ماده دترژان HDTMA در این محیط که برای رشد بسیاری از گونه های میکروبی حالت بازدارندگی دارد. روش کشت مستقیم برروی CAS- آگار با دوروش پلیت نمانیم و محیط دو لایه مقایسه گردید. محیطهای کشت به روش قطره گذاری با 7 میکرولیتر از سوسپانسیون کشت تازه هر باکتری با جمعیت تنظیم شده در محدوده cfu ml^-1 5×10^8 مایه زنی شدند و برای هر سویه سه تکرار منظور گردید. در فواصل 7، 14 و 21 روز انکوباسیون، قطر کلنی حاصل از رشد هرسویه و قطر هاله نارنجی رنگ تشکیل شده در پیرامون آن، اندازه گیری شدند. حداکثر قطر هاله، نسبت قطر هاله به قطر کلنی و سرعت تغییر رنگ محیط برحسب میلی متری در روز، به عنوان معیارهایی برای مقایسه توان تولید سیدروفور سویه های مورد آزمایش در نظر گرفته شدند. نتایج نشان داد که اکثر سویه های ریزوبیومی، قادر به رشد مستقیم برروی محیط CAS- آگار نبودند. سویه های مزوریزبیوم سیسری، بیشترین (3/77%) و سویه های ریزوبیومی دارای توان تولید سیدروفور بودند. معهذا براساس معیارهای مورد سنجش این توان در بین آنها بسیار متفاوت بود. بهترین سویه ها شامل R305 از ریزوبیوم لگومینوزاروم بیووار فازئولی، R253 از گونه های جنس برادی ریزبیوم (Bsp.) و R7 و R38 از سینوریزوبیوم ملیلوتی بودند که حتی در مقایسه با تمام سویه های شاهد، توان تولید سیدروفور بالاتری را نشان دادند.